Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEX3Q00994 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms