Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAE1P78406 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAE1P78406 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAE1P78406 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAE1P78406 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAE1P78406 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAE1P78406 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAE1P78406 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAE1P78406 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAE1P78406 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAE1P78406 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAE1P78406 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAE1P78406 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms