Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
THOP1P52888 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
THOP1P52888 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
THOP1P52888 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms