Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERFP50548 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERFP50548 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERFP50548 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERFP50548 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERFP50548 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERFP50548 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERFP50548 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERFP50548 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERFP50548 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERFP50548 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms