Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP4P49662 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP4P49662 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP4P49662 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP4P49662 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP4P49662 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP4P49662 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CASP4P49662 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP4P49662 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP4P49662 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms