Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCLMP48507 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms