Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CDKN1BP46527 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms