Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GDF5P43026 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GDF5P43026 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GDF5P43026 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GDF5P43026 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GDF5P43026 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDF5P43026 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GDF5P43026 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms