Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAEP38570 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms