Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GGCXP38435 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GGCXP38435 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GGCXP38435 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms