Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms