Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms