Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC1P35052 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC1P35052 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC1P35052 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC1P35052 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC1P35052 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC1P35052 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC1P35052 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC1P35052 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC1P35052 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC1P35052 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC1P35052 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GPC1P35052 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GPC1P35052 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms