Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TSPOP30536 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TSPOP30536 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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