Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms