Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms