Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PSMB9P28065 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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