Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO1P25800 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO1P25800 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO1P25800 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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