Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FGFR3P22607 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms