Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms