Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms