Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF3P18847 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF3P18847 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF3P18847 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF3P18847 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF3P18847 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF3P18847 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF3P18847 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF3P18847 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF3P18847 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF3P18847 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF3P18847 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF3P18847 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF3P18847 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF3P18847 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF3P18847 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF3P18847 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF3P18847 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF3P18847 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF3P18847 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF3P18847 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF3P18847 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF3P18847 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF3P18847 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF3P18847 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms