Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREB1P16220 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREB1P16220 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREB1P16220 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREB1P16220 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREB1P16220 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREB1P16220 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREB1P16220 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREB1P16220 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREB1P16220 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREB1P16220 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREB1P16220 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREB1P16220 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CREB1P16220 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CREB1P16220 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CREB1P16220 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms