Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms