Protein–RNA interactions for Protein: O95389

WISP3, WNT1-inducible-signaling pathway protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WISP3O95389 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WISP3O95389 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WISP3O95389 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WISP3O95389 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WISP3O95389 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WISP3O95389 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WISP3O95389 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WISP3O95389 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WISP3O95389 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WISP3O95389 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
WISP3O95389 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WISP3O95389 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WISP3O95389 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WISP3O95389 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WISP3O95389 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WISP3O95389 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms