Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MTSS1O43312 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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