Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A6NL46 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A6NL46 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NL46 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NL46 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NL46 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NL46 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NL46 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NL46 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NL46 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NL46 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NL46 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NL46 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NL46 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NL46 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NL46 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NL46 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NL46 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NL46 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NL46 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NL46 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A6NL46 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A6NL46 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1931.3 ms