Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3CA6NKF2 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms