Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms