Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF8Q9UPP1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF8Q9UPP1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms