Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCML1Q9UN30 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms