Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLEC4AQ9UMR7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms