Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GALPQ9UBC7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALPQ9UBC7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms