Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC88CQ9P219 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms