Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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RDH8Q9NYR8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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RDH8Q9NYR8 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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RDH8Q9NYR8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
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RDH8Q9NYR8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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RDH8Q9NYR8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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RDH8Q9NYR8 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RDH8Q9NYR8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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