Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJC28Q9NX36 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms