Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREX1Q9NSU2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms