Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms