Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX15Q9NRS6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms