Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A4GALTQ9NPC4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms