Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB9BQ9NP90 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms