Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms