Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDAC8Q9BY41 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms