Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms