Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR3CQ9BUI4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms