Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF4Q9BSR8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms