Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms