Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NIPSNAP1Q9BPW8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms