Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms