Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCMH1Q96GD3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms